花卉对空气的温度，湿度及阳光都有一定的要求。因而花卉保鲜冷库建筑与一般工业冷库和民用冷库建筑不同，有它独特的结构。
1、花卉保鲜冷库的楼板要堆放大量的货物，又要让各种装卸运输机械设备通行，库顶上还要设置制冷设备或管道。因此，它的结构应坚固并具有较大的承载力。
2、花卉保鲜冷库建筑要防止水蒸气的扩散和空气的渗透。室外空气侵入时不但会增加花卉冷库的耗冷量，而且还会向库房内带入水分，水分的凝结引起建筑结构特别是隔热结构受潮冻结损坏，所以要设置防潮隔热层，使花卉冷库建筑具有良好的密封性和防潮隔汽性能。
3、低温环境中，特别是在周期性冻结和融解循环过程中，建筑结构易受破坏。因此，花卉保鲜冷库的建筑材料和冷库的各部分构造要有足够的抗冻性能。
4、花卉保鲜冷库的地基受低温的影响，土壤中的水分易被冻结。因土壤冻结后体积膨胀，会引起地面破裂及整个建筑结构变形，严重的会使冷库不能使用。为此，花卉保鲜冷库地坪除要有有效的隔热层外，隔热层下还需进行处理，以防止土壤冻结。
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